Glossário

Neste glossário, resumimos os principais conceitos e definições dos termos utilizados no texto principal que possam ser desconhecidos ou pouco claros para alguns leitores(as).

Abundance-based Coverage Estimator (ACE): estimador de riqueza de espécies baseado na abundância de espécies raras
Agregação (raster): aumentar o tamanho dos pixels (diminuindo a resolução) de um raster, agregando os valores dos pixels em um pixel maior
Agrupamento filogenético: espécies coexistindo nas comunidades são mais aparentadas do que esperado pelo acaso
Alinhamento (raster): ajusta o tamanho do pixel, extensão, número e origem dos pixels para várias camadas rasters
Ambiente ou Environment (RStudio): porção onde os objetos criados são armazenados
Amostra: subconjunto da população, selecionados por um processo adequado de amostragem, utilizado para estimar características de toda a população
Análise de covariância (ANCOVA): é uma extensão da ANOVA com a adição de uma covariável medida em todas as unidades amostrais
Análise de variância (ANOVA): é um teste estatístico que avalia se há diferenças entre as médias de três ou mais grupos independentes. Existem uma variedade de delineamentos experimentais como - ANOVA de um fator, ANOVA de dois fatores, ANOVA em blocos aleatorizados, ANOVA de medidas repetidas e ANOVA split-splot - que diferem na maneira que o teste estatístico e os graus de liberdade são calculados
Análise paramétrica: assume que os dados foram amostrados de uma distribuição de forma conhecida (e.g., gaussiana, poisson, etc) e estima os parâmetros (e.g., média, desvio padrão, etc) da distribuição a partir dos dados
Análise não paramétrica: não pressupõe que os dados foram amostrados de uma distribuição de forma conhecida (e.g., gaussiana, poisson, etc)
Array: classe de objetos que representa elementos de um único modo no formato de combinação de tabelas, com linhas, colunas e dimensões
Árvore filogenética: são hipóteses que representam a relação de parentesco entre as espécies (pode ser também indivíduos, genes, etc.) com informações sobre quais espécies compartilham um ancestral comum e a distância (tempo, genética, ou diferenças nos caracteres) que as separam
Atributo funcional: uma propriedade mensurável dos organismos (geralmente em nível individual) que representa características morfológicas, fisiológicas ou fenológicas que afetam a aptidão alterando aspectos do crescimento, reprodução e sobrevivência
Atributos dos objetos: são o modo (natureza) e a estrutura (organização) dos elementos nos objetos
Autovalor(Eigenvalue): número inteiro (escalar) que multiplica um vetor, sendo portanto múltiplo deste. Esses valores representam a variância dos eixos e, se convertidos em valores relativos, medem a porcentagem de variância contida em cada eixo.
Autovetor (Eigenvector): vetor não nulo que muda somente quando é multiplicado por um escalar. O autovetor de uma matriz é encontrado pelo resultado da multiplicação de um vetor pela matriz, que é igual a lambda vezes o vetor. Esse vetor do resultado passa a ser o autovetor, e o lambda o seu respectivo autovalor
Bloco (ANOVA): é uma área ou período de tempo dentro do qual as condições ambientais são relativamente homogêneas. O objetivo do uso dos blocos é controlar fontes de variações indesejadas na variável dependente que não são de interesse do pesquisador
Bootstrap: estimador de riqueza de espécies que estima os parâmetros de uma população por reamostragens
Buffer (vetor): polígono que representa a área dentro de uma determinada distância de um dado vetorial, podendo ser a partir de um ponto, linha ou polígono
Camada (vetor ou raster): termo geral, mas geralmente associada à diferentes rasters reunidos num mesmo arquivo
Centroide (vetor ou raster): ponto central de uma feição vetorial ou o centro do pixel do raster
Centróide (multivariado): média ponderada de um conjunto multivariado, a menor distância média de todos os objetos num espaço multivariado
Chao 1: estimador de riqueza de espécies baseado na abundância das espécies singleton e doubletons dentro de uma amostra
Chao 2: estimador de riqueza de espécies baseado na incidência (presença e ausência) das espécies singleton e doubletons dentro de uma amostra
Clado: um grupo de espécies aparentadas descendendo de um único nó na filogenia
Coeficiente de correlação: indica a força da relação linear entre as duas variáveis
Coerção (linguagem R): transformação dos modos dos elementos seguindo uma hierarquia: character > double > integer > logical
Combinação linear: Combinação de várias variáveis (vetores) que são multiplicadas por constantes e adicionadas a outras variáveis. Por exemplo: combinação linear de x, y, z pode ser escrita como ax+by+cz.
Community Mean Nearest Taxon Distance (COMDISTNT): métrica de diversidade beta que calcula a média da distância filogenética/funcional entre o táxon mais próximo das espécies de duas comunidades
Community Mean Pairwise Distance (COMDIST): métrica de diversidade beta que calcula a média da distância filogenética/funcional entre as espécies de duas comunidades
Console (RStudio): onde a versão da linguagem R instalada é carregada para executar os códigos no RStudio
Conversão (linguagem R): transformação dos modos ou estrutura dos elementos de um objeto a partir de funções específicas
Conversões raster-vetor: transformar dados vetoriais em rasters (rasterização) e transformar rasters em vetores (vetorização)
Convex Hull: medida multivariada derivada da computação geométrica que calcula o espaço dos atributos de uma espécie ou de várias espécies em uma comunidade
Correlação: é um teste que mede a força relativa da relação linear entre duas variáveis contínuas. A análise de correlação não assume que a variável X influencie a variável Y, ou que exista uma relação de causa e efeito entre elas
Cortes e máscaras (raster): ajusta o tamanho de um dado raster a uma área menor de interesse, geralmente definido por um dado vetorial
Covariável: variável contínua que potencialmente afeta a variável resposta, mas não é necessariamente controlada ou manipulada pelo pesquisador
Critério de Informação de Akaike (Akaike Information Criterion - AIC): é uma métrica para seleção de modelos. Ele é usado para determinar qual entre os múltiplos modelos é o mais provável de prever os dados observados, ponderando pelo número de parâmetros dos modelos. Os menores valores de AIC representam modelos com melhores ajustes aos dados
Curva de dominância: veja Diagrama de Whittaker
Dados geoespaciais: são dados georreferenciados que expressão informações espaciais, podendo ser no formato vetorial ou matricial (raster)
Dados matriciais (raster): consistem em uma matriz (com linhas e colunas) em que os elementos representam células, geralmente igualmente espaçadas (pixels)
Dados tidy: dados organizados, com foco na limpeza e organização dos mesmos, de modo que os dados estão tidy quando: i) variáveis estão nas colunas, ii) observações estão nas linhas e iii) valores estão nas células, sendo que para esse último, não deve haver mais de um valor por célula
Dados vetoriais: são representações geométricas (pontos, linhas e polígonos) usadas para mapear fenômenos ou objetos espacialmente explícitos que possuem localização ou dimensões bem definidas, aos quais são atribuídas informações tabulares
Data frame: classe de objetos que representa dados no formato de tabela, com linhas e colunas, mas comportam mais de um modo em suas colunas
Data Science: nova área de conhecimento que vem se moldando a partir do desenvolvimento da sociedade em torno da era digital e da grande quantidade de dados gerados e disponíveis pela internet
Datum: simplificadamente é a relação do sistema de coordenadas (geográfica ou projetada) com a superfície da Terra
Dendrograma: diagrama representando uma árvore que organiza elementos, objetos e variáveis por suas semelhanças de maneira hierárquica ascendente. Desse modo, objetos mais próximos compartilham maior semelhança do que objetos distantes no dendrograma.
Desagregação (raster): diminui o tamanho dos pixels (aumentando a resolução) de um raster, preenchendo com novos valores que depende do tipo de função de preenchimento utilizada
Deviance: é um termo estatístico que mede o ajuste do modelo (goodness of fit). Quanto menor o valor de deviance melhor o modelo
Diagrama de Whittaker: método que utiliza informações visuais ao plotar as espécies ranqueadas no eixo X da mais abundante para a menos abundante, enquanto no eixo Y as abundâncias relativas das espécies são plotadas em escala logarítmica
Diretório de trabalho: endereço da pasta (ou diretório) de onde o R importará ou exportar dados
Dispersão filogenética: espécies coexistindo nas comunidades são menos aparentadas do que esperado pelo acaso
Distribuição de probabilidade: é uma função estatística que descreve todos os valores e probabilidades possíveis que uma variável aleatória pode assumir dentro de um determinado intervalo
Distribuição Gaussiana: veja distribuição normal
Distribuição normal: é uma distribuição de probabilidade em formato de sino que é simétrica em torno da média, mostrando que dados próximos à média são mais frequentes que dados distantes da média.
Diversidade alfa: é um conceito caracterizado pela diversidade dentro do habitat ou unidade amostral
Diversidade beta: é um conceito caracterizado pela variação na diversidade entre habitats ou unidades amostrais
Diversidade beta filogenética: engloba métricas que utilizam dados de presença e ausência ou abundância das espécies para determinar um valor que representa a diferença entre comunidades em relação a história evolutiva das linhagens
Diversidade de espécies: é um conceito que representa o número de espécies e a distribuição de abundância destas espécies em uma comunidade
Diversidade filogenética: engloba métricas que capturam a ancestralidade compartilhada entre as espécies em termos de quantidade da história evolutiva e o grau de parentesco entre as espécies
Diversidade funcional: é um conceito que captura a variação no grau de expressão de diferentes atributos funcionais entre diferentes populações, comunidades ou ecossistemas
Diversidade gama: é um conceito caracterizado pela combinação da diversidade alfa e beta ou definido como a diversidade regional englobando todos os habitat ou unidades amostrais
Doubletons: número de espécies observadas com abundância de dois indivíduos
Duplicate: número de espécies observadas em apenas duas amostras
Equitabilidade de Pielou: é uma métrica que descreve o padrão de distribuição da abundância relativa das espécies na comunidade
Erro do Tipo I: rejeitar a hipótese nula de um teste estatístico quando ela é verdadeira
Erro do Tipo II: aceitar a hipótese nula de um teste estatístico quando ela é falsa
Escalar: número inteiro com o qual geralmente se faz operações com matrizes (e.g., multiplicação ou adição)
Escores: posição das unidades amostrais ao longo de um eixo de ordenação. Pode se referir tanto a objetos quanto à variáveis. Escores são fornecidos pela substituição dos valores assumidos pelas variáveis originais nas combinações lineares. São utilizados para ordenar as unidades amostrais em um diagrama uni, bi ou tridimensional
ESRI Shapefile (vetor): principal formato de dados vetoriais, composto por pelo menos de quatro arquivos: .shp (feição), .dbf (tabela de atributos), .shx (ligação entre .shp e .dbf) e .prj (projeção)
Estatística frequentista: são análises paramétricas que estimam probabilidades das frequências observadas dos eventos e usam essas probabilidades como base para inferências.
Estrutura dos objetos: diz respeito à organização dos elementos, com relação aos modos e dimensionalidade da disposição desses elementos. De modo bem simples, os elementos podem ser estruturados em seis tipos: i) vetor, ii) fator, iii) matriz, iv) array, v) data frame e vi) listas
Extensão (vetor e raster): limites geográficos de dados geoespaciais (vetor e raster), composto por dois pares de coordenadas de longitude e de latitude
Extração (vetor e raster): identifica e retorna valores associados de pixels de um raster com base em um objeto vetorial (ponto, linha e polígono)
Extrapolação: é o processo de estimar, além do intervalo de observação original, o valor de uma variável com base em sua relação com outra variável
Fator: classe de objetos que representa o encadeamento de elementos de um único modo (integer) numa sequência unidimensional, representando medidas de uma variável categórica, podendo ser nominal ou ordinal
Fator aleatório: pesquisador amostra aleatoriamente os níveis de um fator na população
Fator fixo: pesquisador controla todos os níveis do fator sobre os quais as inferências devem ser feitas
Fator de inflação da variância (VIF): é um teste que quantifica quanto do erro padrão dos coeficientes estimados estão inflados devido à multicolinearidade
Feição (vetor): um elemento do dado vetorial associado à cada linha da tabela de atributos
Fenômeno: Um evento, entidade ou relação observável
Funções: classe de objetos que possui códigos preparados para realizar uma tarefa específica de modo simples, realizando operações em argumentos
Generalized Least Squares (GLS): é um teste estatístico utilizado para estimar coeficientes desconhecidos de um modelo de regressão linear quando a variável independente é correlacionada com os resíduos
GeoPackage (vetor e raster): banco de dados geoespacial que armazena em apenas um arquivo, dados no formato vetorial, raster e também dados não-espaciais (e.g., tabelas)
GeoTIFF (raster): principal formato para dados raster, composto geralmente de um arquivo TIFF contendo metadados geoespaciais adicionais
GitHub: é um repositório de hospedagem de código-fonte e arquivos com controle de versões de projetos abertos
Goodness of fit: refere-se a um teste estatístico que determina quão bem os dados da amostra se ajustam a uma distribuição de uma população
Grau de liberdade: é o número de observações nos dados que são livres para variar quando estimamos os valores dos parâmetros populacionais desconhecidos
Hipótese: Afirmação testável derivada ou representando vários componentes de uma teoria
Hipótese alternativa (H1): é um conceito estatístico que sugere que diferenças entre grupos ou fenômenos medidos são maiores do que o esperado devido a variações aleatórias. A H1 é o oposto da hipótese nula.
Hipótese nula (H0): é um conceito estatístico que sugere que diferenças entre grupos ou fenômenos medidos não são maiores do que o esperado devido a variações aleatórias. Presume-se que a hipótese nula é verdadeira até que evidências indiquem o contrário.
Homocedasticidade: é um dos pressupostos dos testes paramétricos como ANOVA, Teste T e regressão linear simples que a variância da variável dependente deve ser constante para os valores das variáveis preditoras. Sinônimo de homogeneidade da variância
Homogeneidade da variância: veja homocedasticidade
Independência estatística: dois eventos são independentes se a ocorrência de um evento não influenciar a probabilidade que o outro evento irá ou não ocorrer
Indexação (linguagem R): acessa elementos de objetos por sua posição utilizando os operadores [] e [[]] ou por seu nome com o operador $ depois do nome do objeto
Índice de diversidade: métricas que calculam a riqueza de espécies e a distribuição de abundância para cada espécie dentro das comunidades.
Índice de Gini-Simpson: métrica que quantifica a probabilidade de dois indivíduos retirados ao acaso da comunidade pertencerem a espécies diferentes. É o inverso do índice de Simpson
Índice de Margalef: métrica que calcula a riqueza de espécies ponderando a abundância total dentro de cada comunidade
Índice de Menhinick: métrica que calcula a riqueza de espécies ponderando a abundância total dentro de cada comunidade
Índice de Shannon-Wiener: métrica de diversidade de espécies que quantifica a incerteza associada em predizer a identidade de uma espécie dado o número de espécies e a distribuição de abundância para cada espécie
Índice de Simpson: métrica que quantifica a probabilidade de dois indivíduos retirados ao acaso da comunidade pertencerem à mesma espécie
Inf (Infinito): é um número muito grande ou um limite matemático
Interação raster-vetor: operações derivadas da interação entre raster-vetor, como ajuste do tamanho do raster ou extração dos valores dos pixels para dados vetoriais (pontos, linhas e polígonos)
Interpolação: é o processo de estimar, dentro um domínio de valores conhecidos, um valor desconhecido com base em sua relação com outra variável
Jackknife 1: estimador de riqueza de espécies baseado no número de espécies que ocorrem em somente uma amostra (uniques)
Jackknife 2: estimador de riqueza de espécies baseado no número de espécies que ocorrem em somente uma amostra (uniques) e no número de espécies ocorrem em exatamente duas amostras (duplicates)
Junção de tabelas: combinação de pares de conjunto de dados tabulares por uma ou mais colunas chaves
Likelihood-ratio test (LRT): é um teste estatístico que mede o grau do ajuste (goodness-of-fit) entre dois modelos aninhados. Um modelo relativamente mais complexo é comparado a um modelo mais simples para ver se ele se ajusta significativamente melhor a um determinado conjunto de dados. Ele testa se há necessidade de se incluir uma variável extra no modelo para explicar os dados
Linguagem R: ambiente de software livre para computação estatística e criação de gráficos
Lista: classe de objetos que é um tipo especial de vetor que aceita objetos como elementos
Loading: Correlações de Pearson entre cada variável original com cada eixo. Os valores serão maiores (positiva ou negativamente) para aquelas variáveis que forem mais importantes na formação de um dado eixo. Desse modo, representam o peso de uma variável para a construção de um eixo e variam de -1 a 1.
Loop for: função em que um bloco de códigos é repetido mudando um contador de uma lista de possibilidades
Mapa: representação bidimensional de elementos geoespaciais em uma proporção menor, podendo representar dados vetoriais ou raster, com diversos elementos visuais e textuais que facilitam a interpretação dos elementos geoespaciais mapeados
Mapas animados: mapas que incorporam animações para expressar mudanças nos padrões espaciais ou ao longo do tempo
Mapas estáticos: mapas simples e fixos para visualização de dados, sendo o tipo mais comum de saída visual
Mapas interativos: mapas que incorporam a capacidade de deslocar e ampliar qualquer parte de um conjunto de dados geoespaciais sobreposto em um “mapa da web”
Matriz: classe de objetos que representa elementos de um único modo no formato de tabela, com linhas e colunas
Máxima Verossimilhança: é um método que determina valores para os parâmetros de um modelo. Os valores dos parâmetros são encontrados de tal forma que maximizam a probabilidade de que o processo descrito pelo modelo produza os dados que foram realmente observados
Mean Pairwise Distance (MPD): é uma métrica que utiliza a matriz de distância filogenética para quantificar a distância média do parentesco entre pares de espécies em uma comunidade
Mean Nearest Taxon Distance (MNTD): é uma métrica que utiliza a matriz de distância filogenética para quantificar a média dos valores mínimos de parentesco entre pares de espécies em uma comunidade. Ou seja, qual o valor médio da distância para o vizinho mais próximo
Mecanismo: Interação direta de uma relação causal que resulta em um fenômeno
Modo dos objetos: diz respeito à natureza dos elementos que compõem os dados e que foram atribuídos aos objetos. Os modos geralmente são: numérico do tipo inteiro (integer), numérico do tipo flutuante (double), texto (character), lógico (logical) ou complexo (complex)
Modelo misto: pelo menos um fator no experimento é fixo, e pelo menos um fator é aleatório.
Modelo nulo: é um procedimento estatístico que usa aleatorizações para gerar distribuições de valores para uma determinada variável de interesse na ausência do processo causal em questão
Multicolinearidade: é um conceito estatístico onde variáveis independentes em um modelo são correlacionadas
NA (Not Available): significa dado faltante ou indisponível
NaN (Not a Number): representa indefinições matemáticas
Nearest Relative Index (NRI): métrica que calcula o tamanho do efeito padronizado para a métrica Mean Pairwise Distance.Valores positivos de NRI indicam agrupamento filogenético enquanto valores negativos de NRI indicam dispersão filogenética
Nearest Taxon Index (NTI): métrica que calcula o tamanho do efeito padronizado para a métrica Mean Nearest Taxon Distance.Valores positivos de NTI indicam agrupamento filogenético enquanto valores negativos de NTI indicam dispersão filogenética
NetCDF (raster): Network Common Data Form é um conjunto de bibliotecas de software e formatos de dados independentes que suportam a criação, acesso e compartilhamento de dados científicos orientados a arrays
Nó: o ponto onde uma linhagem dá origem a duas ou mais linhagens descendentes
Normalidade dos resíduos: é um dos pressupostos dos testes paramétricos como ANOVA, Teste T e regressão linear simples que dependem que os resíduos do modelo apresentem distribuição normal ou gaussiana.
NULL (Nulo): representa um objeto nulo, sendo útil para preenchimento em aplicações de programação
Números de Hill: é uma métrica que transforma a riqueza e a distribuição da abundância das espécies em números efetivos de espécies ou diversidade verdadeira
Número efetivo de espécies: é o número de espécies igualmente abundantes (i.e., todas as espécies com a mesma abundância) necessárias para produzir o valor observado para um determinado índice
Objetos: palavras às quais são atribuídos dados através da atribuição. A criação de objetos possibilita a manipulação de dados ou armazenar os resultados de análises. Em outras linguagens de programação são denominados variáveis
Operações geoespaciais: são operações para acessar ou alterar as propriedades não-espaciais, espaciais e geométricas dos dados geoespaciais, divididas em: operações de atributos, operações espaciais e operações geométricas
Operações geoespaciais de atributos: modificação de objetos geoespaciais baseado em informações não espaciais associadas a dados geoespaciais, como a tabela de atributos ou valores das células e nome das camadas dos rasters
Operações geoespaciais espaciais: modificações de objetos geoespaciais baseado em informações espaciais, como localização e formato
Operações geoespaciais geométricas: modificações em objetos geoespaciais baseado na geometria do vetor ou do raster e na interação e conversão entre vetor-raster
Operadores: conjuntos de caracteres que realiza operações, agrupados em cinco tipos principais: aritméticos, relacionais, lógicos, atribuição e diversos
Pacotes (linguagem R): conjuntos extras de funções para executar tarefas específicas
Padrão: Eventos repetidos, entidades recorrentes ou relações replicadas no tempo ou no espaço
Phylogenetic Diversity (PD): é uma métrica definida pela soma do comprimento dos ramos conectando todas as espécies na comunidade
Phylogenetic Endemism (PE): é uma métrica que calcula a fração dos ramos restritos a regiões específicas
Phylogenetic index of beta diversity (Phylosor): métrica de similaridade que determina o comprimento total dos ramos da filogenia que é compartilhado entre pares de comunidades
Phylogenetic Species Richness (PSR): é uma métrica diretamente comparável ao número de espécies na comunidade, mas inclui o parentesco filogenético entre as espécies
Phylogenetic Species Variability (PSV): é uma métrica que estima a quantidade relativa dos comprimentos dos ramos não compartilhados entre as comunidades
Pipe (%>%): operador implementado por uma função que faz com o que o resultado de uma função seja o primeiro argumento da função seguinte, permitindo o encadeamento de várias funções eliminando a necessidade de criar objetos para armazenar resultados intermediários
Pivotagem de dados: transporte de dados que estão em linhas para colunas e vice-versa, fazendo a referência cruzada ou rotacionando os dados. Partirmos de dados no formato longo (long, muitas linhas e poucas colunas) e criamos dados no formato largo (wide, poucas linhas e muitas colunas) e vice-versa
Pixel (raster): também chamado célula, é a unidade geoespacial do raster, representando o elemento da matriz de dados
Polígono convexo: operação que liga os pontos externos de um conjunto de pontos e cria um polígono a partir deles
Polígono de Voronoi: polígonos irregulares são criados a partir da proximidade dos pontos, de modo a estimar uma área de abrangência no entorno dos mesmos
Politomia: três ou mais linhagens descendendo de um único nó
População: é um conjunto de indivíduos ou elementos semelhantes que interessa para alguma pergunta ou hipótese
População amostral: é um conjunto de indivíduos ou elementos semelhantes que estão de fato acessível para serem amostrados
Predição espacial: utiliza os coeficientes de um modelo ajustado para gerar um raster de predição para todos os pixels considerando os dados preditores de entrada do modelo, extrapolando a predição da resposta
Predição: uma declaração de expectativa deduzida da estrutura lógica ou derivada da estrutura causal de uma teoria
Pressuposto: condições necessárias para sustentar uma hipótese ou construção da teoria
Principais elementos de um mapa: um mapa possui diversos elementos que facilitam sua interpretação, dentre eles: i) mapa principal, ii) mapa secundário iii) título, iv) legenda (apresentando as informações detalhadas das classes ou escala de valores, v) barra de escala, vi) indicador de orientação (Norte), vii) gride de coordenadas e viii) descrição do CRS
Processo: um subconjunto de fenômenos em que os eventos seguem uns aos outros no tempo ou espaço, que podem ou não serem causalmente conectados. É a causa, mecanismo ou limitação explicando um padrão
Programação Funcional: organização do código como funções e variáveis que trabalham de forma unificada para a resolução de um problema
Projeto do RStudio: arquivo no formato .Rproj que facilita o trabalho com o RStudio, pois define o diretório automaticamente e permite o controle de versão
Pull request: é um método de submeter contribuições que serão revisadas pelos responsáveis de um projeto de desenvolvimento aberto
Raiz: representa o ancestral comum de todas as espécies na filogenia
Ramo: uma linha orientada ao longo de um eixo terminais-raiz que conecta os nós na filogenia
Rarefação: é uma métrica usada para calcular o número esperado de espécies em cada comunidade tendo como base comparativa um valor em que todas as amostras ou número de indivíduos atinjam um tamanho padrão entre as comunidades
Rarefação baseada nas amostras (Sampled-based): as comparações são padronizadas pela comunidade com menor número de amostragens
Rarefação baseada na cobertura (Coverage-based): é uma medida que determina a proporção de amostras ou do número de indivíduos da comunidade que representa as espécies amostradas
Rarefação baseada nos indivíduos (Individual-based): as comparações são feitas considerando a abundância da comunidade padronizada pelo menor número de indivíduos
Rasterização: conversão de dados vetoriais para raster realizada de pontos, linhas ou polígonos para rasters
Regressão: é um teste usado para analisar a relação entre uma ou mais variáveis preditoras (Xn) e uma variável resposta (Y). A regressão assume uma relação de causa e efeito entre as variáveis
Reprojeção: transformação do Sistema de Referência de Coordenadas (CRS) de um dado geoespacial, alterando o CRS original para outro. Na reprojeção alteramos tanto a unidade do dado geoespacial (unidades em ‘longitude/latitude’ ou unidades de metros), quanto o Datum datum
Resíduo: é a diferença entre os valores preditos e observados dos dados. São também chamados de erro
Resolução (raster): termo amplo que pode ser usado em diversos contextos. Para dados raster, é geralmente associado ao tamanho (dimensão) do pixel (i.e., altura e largura)
RStudio: ambiente de desenvolvimento integrado (IDE) para R. Inclui um console, editor de realce de sintaxe que suporta execução direta de código, bem como ferramentas para plotagem, histórico, depuração e gerenciamento de espaço de trabalho
Script (RStudio): arquivos de texto simples, criados com a extensão (terminação) .R onde os códigos são escritos e salvos
Seleção de modelos: é um processo usado para comparar o valor relativo de diferentes modelos estatísticos e determinar qual deles é o mais adequado para os dados observados
Série de Hill: veja Número de Hill
Singleton: número de espécies observadas com abundância de um indivíduo
Sistema de Coordenadas: composto por dois sistemas, o Sistema de Coordenadas Geográficas e o Sistema de Coordenadas Projetadas, que ângulos e metros, respectivamente
Sistema de Referência de Coordenadas (CRS): também chamada projeção, define a referência geoespacial dos dados vetor e raster na superfície da Terra, composto pelo Sistema de Coordenadas e Datum
Tabela de atributos: dado tabular que inclui dados geoespaciais e dados alfanuméricos, geralmente associada a dados vetoriais
Terminal (do inglês tip): o final do ramo representando uma espécie atual ou extinta (pode também representar gêneros, indivíduos, genes, etc.)
Teste de Levene: é um teste estatístico utilizado para verificar a homogeneidade da variância entre dois ou mais grupos
Teste de Shapiro-Wilk: é um teste estatístico utilizado para verificar se os dados apresentam distribuição normal
Teste T (de Student): é um teste estatístico que segue uma distribuição t de Student para rejeitar ou não uma hipótese nula de médias iguais entre dois grupos
Teste T pareado: é um teste estatístico que usa dados medidos duas vezes na mesma unidade amostral, resultando em pares de observações para cada amostra (amostras pareadas). Ele determina se a diferença da média entre duas observações é zero
Tibble: classe de objetos que é uma versão aprimorada do data frame. É a classe aconselhada para que as funções do tidyverse funcionem melhor sobre conjuntos de dados tabulares
tidyverse: “dialeto novo” para a linguagem R, onde tidy quer dizer organizado, arrumado, ordenado, e verse é universo. Operacionalizado no R através de uma coleção de pacotes que atuam no fluxo de trabalho comum da ciência de dados: importação, manipulação, exploração, visualização, análise e comunicação de dados e análises. O principal objetivo do tidyverse é aproximar a linguagem para melhorar a interação entre ser humano e computador sobre dados, de modo que os pacotes compartilham uma filosofia de design de alto nível e gramática, além da estrutura de dados de baixo nível
Ultramétrica: a distância de todos os terminais até a raiz são idênticas. Característica requerida pela maioria dos índices de diversidade filogenética
Unidade amostral: é o indivíduo (ou elemento) da população amostral sobre o qual a medida de interesse será observada
Unique: número de espécies observadas em apenas uma amostra
Unique Fraction metric (UniFrac): métrica de dissimilaridade que determina a fração única da filogenia contida em cada uma das duas comunidades
Valor de P: probabilidade de um teste estatístico ser igual ou maior que o observado, dado que a hipótese nula é verdadeira
Valores faltantes e especiais: valores reservados que representam dados faltantes, indefinições matemáticas, infinitos e objetos nulos
Variance of Pairwise Distance (VPD): é uma métrica que utiliza a matriz de distância filogenética para quantificar a variância do parentesco entre pares de espécies em uma comunidade
Variável categórica: são variáveis que não possuem valores quantitativos e são definidas por categorias ou grupos distintos
Variável contínua: são variáveis numéricas que têm um número infinito de valores entre dois valores quaisquer. Neste caso, valores fracionais fazem sentido
Variável dependente: é uma variável mensurada ou observada de interesse do pesquisador que depende do valor de outra variável
Variável discreta: é uma variável numérica que têm um número contável de valores inteiros
Variável explicativa: ver variável independente
Variável independente: variável mensurada ou observada pelo pesquisador que prevê ou afeta a variável dependente
Variável nominal: são variáveis categóricas que não apresentam ordenação dentre as categorias (e.g., preto, branco e rosa)
Variável ordinal: são variáveis categóricas com ordenação entre as categorias (e.g., pequeno, médio e grande)
Variável preditora: ver variável independente
Variável resposta: ver variável dependente
Variograma: é uma descrição da continuidade espacial dos dados. Ele mede a variabilidade entre pares de pontos em várias distâncias
Vetor: classe de objetos que representa o encadeamento de elementos de um único modo numa sequência unidimensional
Vetor (Multivariada): coluna de uma matriz
Vetorização (vetor): conversão de dados rasters para vetor, sendo que esse vetor receberá os valores dos pixels do raster, podendo ser convertido em pontos, isolinhas ou polígonos

15 Dados geoespaciais

Referências